特別天然記念物・天然記念物はその希少性と美しさから、多くの観光客に人気です。ここでは、観光で立ち寄れる生息地や保護区域などを紹介します。自然の美しさを楽しむとともに、ルールを守って観察しましょう。
動物
ウシ
- 見島牛：山口県萩市（見島ウシ産地）
ウマ
- 岬馬：宮崎県串間市（岬馬およびその繁殖地）
- 対州馬：長崎県対馬市（対馬列島）
- トカラ馬：鹿児島県鹿児島郡十島村（中之島）
コウモリ
- エラブオオコウモリ：鹿児島県熊毛郡屋久島町（口永良部島）
- テングコウモリなど：岩手県下閉伊郡岩泉町（岩泉湧窟及びコウモリ）
ニホンザル
- 青森県むつ市（下北半島のサルおよびサル生息北限地）
- 千葉県富津市・君津市（高宕山のサル生息地）
- 大阪府箕面市（箕面山のサル生息地）
- 岡山県高梁市（臥牛山のサル生息地）
- 大分県大分市（高崎山のサル生息地）
- 宮崎県串間市（幸嶋サル生息地）
シカ
- ニホンジカ：奈良県奈良市（奈良の鹿）
- マゲシカ：鹿児島県西之表市（馬毛島）
- ケラマジカ：沖縄県座間味村（ケラマジカおよびその生息地）
ネコ
- ツシマヤマネコ：長崎県対馬市（対馬列島）
- イリオモテヤマネコ：沖縄県八重山郡竹富町（西表島）
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鳥類
- アホウドリ：東京都・伊豆諸島（鳥島）
- イヌワシ：岩手県岩泉町・宮城県石巻市など（イヌワシ繁殖地）
- ウ：福島県いわき市（照島ウ生息地）
- ウミネコ：青森県八戸市（蕪島ウミネコ繁殖地）、岩手県陸前高田市（椿島ウミネコ繁殖地）、宮城県女川町（陸前江ノ島のウミネコおよびウトウ繁殖地）、山形県酒田市（飛島ウミネコ繁殖地）、島根県出雲市（経島ウミネコ繁殖地）
- オオワシ：北海道東部・本州北部など
- コウノトリ：兵庫県豊岡市・福井県越前市・千葉県野田市など
- シラコバト：埼玉県越谷市（越ヶ谷のシラコバト）
- タンチョウ：北海道釧路市（釧路湿原）
- ツル：山口県周南市・下松市（八代のツルおよびその渡来地）、鹿児島県出水市（鹿児島県のツルおよびその渡来地）
- トキ：新潟県佐渡市など
- ハクチョウ：青森県東津軽郡平内町（小湊のハクチョウおよびその渡来地）
- ヤンバルクイナ：沖縄県北部地域
- ライチョウ：北アルプス・南アルプスなど本州中部の標高2,200～2,400ｍ以上の高山帯
爬虫類
カメ
- アカウミガメ：静岡県御前崎市、徳島県海部郡美波町（大浜海岸）
- イシガメ・クサガメ：山口県萩市（見島のカメ生息地）
ヘビ
- 山口県岩国市（岩国のシロヘビ）
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魚
- イトヨ：福井県（本願清水イトヨ生息地）
- ウナギ：福島県いわき市（賢沼ウナギ生息地）
- オオウナギ：和歌山県白浜町・徳島県海部町・長崎県野母崎町（オオウナギ生息地）
- タイ：千葉県鴨川市（鯛の浦タイ生息地）
両生類
- オオサンショウウオ：岐阜県・三重県・兵庫県・広島県・島根県・鳥取県・岡山県・大分県など（オオサンショウウオ生息地）
その他
- カブトガニ：岡山県笠岡市（カブトガニ繁殖地）、佐賀県伊万里市（伊万里湾カブトガニ繁殖地）
- ゲンジボタル：長野県下高井郡山ノ内町（志賀高原石の湯のゲンジボタル生息地）、滋賀県米原市（長岡のゲンジボタルおよびその発生地）、京都府京都市（清滝川のゲンジボタルおよびその生息地）
- ミカドアゲハ：高知県高知市（ミカドアゲハおよびその生息地）
- ホタルイカ：富山県・富山湾（ホタルイカ群遊海面）